滤毒式通风系统由除尘滤毒设备，进、排风机，管道，密闭阀门及消波设施等组成。当工程受到敌人核生化武器打击，有人员急需进出工事，或室内CO2浓度升到1.5%以上，O2降到19%以下人员难以忍受时，并证明是该滤毒器能过滤的毒剂，且室外浓度较低时，才可以转入滤毒式通风。滤毒式通风时，工程要超压排风（全工程超压排风或局部超压排风），以防止工程外毒气渗入工程内。超压排风必须通过口部洗消间和防毒通道，以保证此时进出工程人员安全。滤毒式通风时，该管道上的密闭阀门必须与进、排风连锁控制，以确保进、排风系统安全。